Hello,
I saw in a few texts that there was at some point plans to make have METransform functionality in NEURON. I was wondering if that ever came to fruition, and if so, where I could find this.
Thanks,
Adam
Morphoelectrotonic Transform
-
ted
- Site Admin
- Posts: 6398
- Joined: Wed May 18, 2005 4:50 pm
- Location: Yale University School of Medicine
- Contact:
Re: Morphoelectrotonic Transform
"Morphoelectrotonic"? Now _there's_ a 50 cent word if there ever was one. Maybe you are interested in the GUI's impedance tools, which use the electrotonic transformation to map between anatomical space, where the separation between points is measured in units of physical distance, to electrotonic space, where it is measured in units of log(attenuation). Has been part of NEURON for maybe 15 years now, and we've been teaching about it in the NEURON hands-on course since 1998 or so. Check out the link "Analyzing electrotonus" at
http://www.neuron.yale.edu/neuron/stati ... ndson.html
http://www.neuron.yale.edu/neuron/stati ... ndson.html
Re: Morphoelectrotonic Transform
Hi Ted,ted wrote:"Morphoelectrotonic"? Now _there's_ a 50 cent word if there ever was one. Maybe you are interested in the GUI's impedance tools, which use the electrotonic transformation to map between anatomical space, where the separation between points is measured in units of physical distance, to electrotonic space, where it is measured in units of log(attenuation). Has been part of NEURON for maybe 15 years now, and we've been teaching about it in the NEURON hands-on course since 1998 or so. Check out the link "Analyzing electrotonus" at
http://www.neuron.yale.edu/neuron/stati ... ndson.html
Thanks for the references, the Impedence tools are great! Is there a way to suppress output so I don't get those matrices when calling compute with the extended impedence calculation? Also, I was wondering if I could find a reference in the NEURON book or elsewhere that goes into how the tools actually work (not how to use them, but how they are implemented).
Thanks again,
Adam
-
ted
- Site Admin
- Posts: 6398
- Joined: Wed May 18, 2005 4:50 pm
- Location: Yale University School of Medicine
- Contact:
Re: Morphoelectrotonic Transform
Yes, they are.adamimos wrote:the Impedence tools are great!
I don't see anything like that. What OS and which version of NEURON are you using?Is there a way to suppress output so I don't get those matrices when calling compute with the extended impedence calculation?
It's all done in the frequency domain, with the Impedance class, which is documented in the Programmer's Reference. You'll find lots of hoc source code in nrn/share/lib/hoc/imp*hocI was wondering if I could find a reference in the NEURON book or elsewhere that goes into how the tools actually work (not how to use them, but how they are implemented).
Re: Morphoelectrotonic Transform
ted wrote:Yes, they are.adamimos wrote:the Impedence tools are great!I don't see anything like that. What OS and which version of NEURON are you using?Is there a way to suppress output so I don't get those matrices when calling compute with the extended impedence calculation?It's all done in the frequency domain, with the Impedance class, which is documented in the Programmer's Reference. You'll find lots of hoc source code in nrn/share/lib/hoc/imp*hocI was wondering if I could find a reference in the NEURON book or elsewhere that goes into how the tools actually work (not how to use them, but how they are implemented).
I am using OS X.6.4
and version 7.1 of the program
for instance when I run the following code (which I found in a separate thread):
Code: Select all
load_file("nrngui.hoc")
objref out
out = new File()
out.wopen("out.dat")
// toy model cell
create soma, dend, axon
access soma
connect axon(0), soma(0)
connect dend(0), soma(1)
soma {
diam = 30 L = 30
insert pas
g_pas /= 20
e_pas = -65 // same as HH resting potential
}
dend {
diam(0:1) = 2:0.5 L = 600
insert pas
g_pas /= 20
e_pas = -65 // same as HH resting potential
}
axon {
diam = 1 L = 1000
insert hh
}
// specify reasonable values for nseg--see
// http://www.neuron.yale.edu/neuron/static/docs/d_lambda/d_lambda.html
freq = 100 // Hz, frequency at which AC length constant will be computed
d_lambda = 0.1
func lambda_f() { // currently accessed section, $1 == frequency
return 1e5*sqrt(diam/(4*PI*$1*Ra*cm))
}
proc geom_nseg() {
soma area(0.5) // make sure diam reflects 3d points
forall { nseg = int((L/(d_lambda*lambda_f(freq))+0.9)/2)*2 + 1 }
}
geom_nseg()
// prepare to use Impedance class
// always a good idea to finitialize before computing impedance
v_init=-65
finitialize(v_init)
// demonstrate use of impedance class
objref zz
zz = new Impedance()
FREQ = 0 // Hz
WHERE = 0.5 // location in the soma that is the reference point
soma distance(0, WHERE) // sets origin for distance calculations
proc calcZ() {
soma zz.loc(WHERE) // sets origin for impedance calculations
/*
zz.compute() assumes conductances depend only on v, i.e.
ignores the impedance contributions of gating state differential equations
*/
zz.compute(FREQ, 1) // takes the impedance contributions of
// gating state differential equations into account
// but requires mechanisms to be compatible with CVODE
print "x distance(x) input(x) input_phase(x) transfer(x) transfer_phase(x) ratio(x)"
forall {
for (x) out.printf("%f\t%f\t%f\t%f\t%f\t%f\t%f\n",x, distance(x), zz.input(x), zz.input_phase(x), zz.transfer(x), zz.transfer_phase(x), zz.ratio(x))
}
}
calcZ()
out.close()
I get the following):
Code: Select all
Last login: Tue Mar 29 15:22:27 on console
>> nrngui zTest.hoc
NEURON -- Release 7.1 (359:7f113b76a94b) 7f113b76a94b
Duke, Yale, and the BlueBrain Project -- Copyright 1984-2008
See http://www.neuron.yale.edu/credits.html
1
1
1
MATRIX SUMMARY
Size of matrix = 102 x 102.
Matrix before factorization:
1 2 3 4 5 6 7
1 133 -133 ... -0.0932 ... ... ...
0j 0j 0j
2 -4.71 9.42 -4.71 ... ... ... ...
0j 0j 0j
3 ... -133 133 ... ... ... ...
0j 0j
4 -0.0623 ... ... 0.0941 -0.0311 ... ...
0j 0j 0j
5 ... ... ... -0.0311 0.063 -0.0311 ...
0j 0j 0j
6 ... ... ... ... -0.0311 0.063 -0.0311
0j 0j 0j
7 ... ... ... ... ... -0.0311 0.063
0j 0j
8 ... ... ... ... ... ... -0.0311
0j
9 ... ... ... ... ... ... ...
10 ... ... ... ... ... ... ...
11 ... ... ... ... ... ... ...
12 ... ... ... ... ... ... ...
13 ... ... ... ... ... ... ...
14 ... ... ... ... ... ... ...
15 ... ... ... ... ... ... ...
16 ... ... ... ... ... ... ...
17 ... ... ... ... ... ... ...
18 ... ... ... ... ... ... ...
19 ... ... ... ... ... ... ...
20 ... ... ... ... ... ... ...
21 ... ... ... ... ... ... ...
22 ... ... ... ... ... ... ...
23 ... ... ... ... ... ... ...
24 ... ... ... ... ... ... ...
25 ... ... ... ... ... ... ...
26 ... ... -0.0829 ... ... ... ...
0j
27 ... ... ... ... ... ... ...
28 ... ... ... ... ... ... ...
29 ... ... ... ... ... ... ...
30 ... ... ... ... ... ... ...
31 ... ... ... ... ... ... ...
32 ... ... ... ... ... ... ...
33 ... ... ... ... ... ... ...
34 ... ... ... ... ... ... ...
35 ... ... ... ... ... ... ...
36 ... ... ... ... ... ... ...
37 ... ... ... ... ... ... ...
38 ... ... ... ... ... ... ...
39 ... ... ... ... ... ... ...
40 ... ... ... -0.0278 ... ... ...
0j
41 ... ... ... 0.00415 ... ... ...
0j
42 ... ... ... -0.00283 ... ... ...
0j
43 ... ... ... ... -0.0278 ... ...
0j
44 ... ... ... ... 0.00415 ... ...
0j
45 ... ... ... ... -0.00283 ... ...
0j
46 ... ... ... ... ... -0.0278 ...
0j
47 ... ... ... ... ... 0.00415 ...
0j
48 ... ... ... ... ... -0.00283 ...
0j
49 ... ... ... ... ... ... -0.0278
0j
50 ... ... ... ... ... ... 0.00415
0j
51 ... ... ... ... ... ... -0.00283
0j
52 ... ... ... ... ... ... ...
53 ... ... ... ... ... ... ...
54 ... ... ... ... ... ... ...
55 ... ... ... ... ... ... ...
56 ... ... ... ... ... ... ...
102 ... ... ... ... ... ... ...
85 86 87 88 89 90 91
1 ... ... ... ... ... ... ...
2 ... ... ... ... ... ... ...
3 ... ... ... ... ... ... ...
4 ... ... ... ... ... ... ...
5 ... ... ... ... ... ... ...
6 ... ... ... ... ... ... ...
7 ... ... ... ... ... ... ...
8 ... ... ... ... ... ... ...
9 ... ... ... ... ... ... ...
10 ... ... ... ... ... ... ...
11 ... ... ... ... ... ... ...
12 ... ... ... ... ... ... ...
13 ... ... ... ... ... ... ...
14 ... ... ... ... ... ... ...
15 ... ... ... ... ... ... ...
16 ... ... ... ... ... ... ...
17 ... ... ... ... ... ... ...
18 ... ... ... ... ... ... ...
19 -0.0705 -0.00205 0.0557 ... ... ... ...
0j 0j 0j
20 ... ... ... -0.0705 -0.00205 0.0557 ...
0j 0j 0j
21 ... ... ... ... ... ... -0.0705
0j
22 ... ... ... ... ... ... ...
23 ... ... ... ... ... ... ...
24 ... ... ... ... ... ... ...
25 ... ... ... ... ... ... ...
26 ... ... ... ... ... ... ...
27 ... ... ... ... ... ... ...
28 ... ... ... ... ... ... ...
29 ... ... ... ... ... ... ...
30 ... ... ... ... ... ... ...
31 ... ... ... ... ... ... ...
32 ... ... ... ... ... ... ...
33 ... ... ... ... ... ... ...
34 ... ... ... ... ... ... ...
35 ... ... ... ... ... ... ...
36 ... ... ... ... ... ... ...
37 ... ... ... ... ... ... ...
38 ... ... ... ... ... ... ...
39 ... ... ... ... ... ... ...
40 ... ... ... ... ... ... ...
41 ... ... ... ... ... ... ...
42 ... ... ... ... ... ... ...
43 ... ... ... ... ... ... ...
44 ... ... ... ... ... ... ...
45 ... ... ... ... ... ... ...
46 ... ... ... ... ... ... ...
47 ... ... ... ... ... ... ...
48 ... ... ... ... ... ... ...
49 ... ... ... ... ... ... ...
50 ... ... ... ... ... ... ...
51 ... ... ... ... ... ... ...
52 ... ... ... ... ... ... ...
53 ... ... ... ... ... ... ...
54 ... ... ... ... ... ... ...
55 ... ... ... ... ... ... ...
56 ... ... ... ... ... ... ...
57 ... ... ... ... ... ... ...
58 ... ... ... ... ... ... ...
59 ... ... ... ... ... ... ...
60 ... ... ... ... ... ... ...
61 ... ... ... ... ... ... ...
62 ... ... ... ... ... ... ...
63 ... ... ... ... ... ... ...
64 ... ... ... ... ... ... ...
65 ... ... ... ... ... ... ...
66 ... ... ... ... ... ... ...
67 ... ... ... ... ... ... ...
68 ... ... ... ... ... ... ...
69 ... ... ... ... ... ... ...
70 ... ... ... ... ... ... ...
71 ... ... ... ... ... ... ...
72 ... ... ... ... ... ... ...
73 ... ... ... ... ... ... ...
74 ... ... ... ... ... ... ...
75 ... ... ... ... ... ... ...
76 ... ... ... ... ... ... ...
77 ... ... ... ... ... ... ...
78 ... ... ... ... ... ... ...
79 ... ... ... ... ... ... ...
80 ... ... ... ... ... ... ...
81 ... ... ... ... ... ... ...
82 ... ... ... ... ... ... ...
83 ... ... ... ... ... ... ...
84 ... ... ... ... ... ... ...
85 4.22 ... ... ... ... ... ...
0j
86 ... 0.117 ... ... ... ... ...
0j
87 ... ... 0.183 ... ... ... ...
0j
88 ... ... ... 4.22 ... ... ...
0j
89 ... ... ... ... 0.117 ... ...
0j
90 ... ... ... ... ... 0.183 ...
0j
91 ... ... ... ... ... ... 4.22
0j
92 ... ... ... ... ... ... ...
93 ... ... ... ... ... ... ...
94 ... ... ... ... ... ... ...
95 ... ... ... ... ... ... ...
96 ... ... ... ... ... ... ...
97 ... ... ... ... ... ... ...
98 ... ... ... ... ... ... ...
99 ... ... ... ... ... ... ...
100 ... ... ... ... ... ... ...
101 ... ... ... ... ... ... ...
102 ... ... ... ... ... ... ...
92 93 94 95 96 97 98
1 ... ... ... ... ... ... ...
2 ... ... ... ... ... ... ...
3 ... ... ... ... ... ... ...
4 ... ... ... ... ... ... ...
5 ... ... ... ... ... ... ...
6 ... ... ... ... ... ... ...
7 ... ... ... ... ... ... ...
8 ... ... ... ... ... ... ...
9 ... ... ... ... ... ... ...
10 ... ... ... ... ... ... ...
11 ... ... ... ... ... ... ...
12 ... ... ... ... ... ... ...
13 ... ... ... ... ... ... ...
14 ... ... ... ... ... ... ...
15 ... ... ... ... ... ... ...
16 ... ... ... ... ... ... ...
17 ... ... ... ... ... ... ...
18 ... ... ... ... ... ... ...
19 ... ... ... ... ... ... ...
20 ... ... ... ... ... ... ...
21 -0.00205 0.0557 ... ... ... ... ...
0j 0j
22 ... ... -0.0705 -0.00205 0.0557 ... ...
0j 0j 0j
23 ... ... ... ... ... -0.0705 -0.00205
0j 0j
24 ... ... ... ... ... ... ...
25 ... ... ... ... ... ... ...
26 ... ... ... ... ... ... ...
27 ... ... ... ... ... ... ...
28 ... ... ... ... ... ... ...
29 ... ... ... ... ... ... ...
30 ... ... ... ... ... ... ...
31 ... ... ... ... ... ... ...
32 ... ... ... ... ... ... ...
33 ... ... ... ... ... ... ...
34 ... ... ... ... ... ... ...
35 ... ... ... ... ... ... ...
36 ... ... ... ... ... ... ...
37 ... ... ... ... ... ... ...
38 ... ... ... ... ... ... ...
39 ... ... ... ... ... ... ...
40 ... ... ... ... ... ... ...
41 ... ... ... ... ... ... ...
42 ... ... ... ... ... ... ...
43 ... ... ... ... ... ... ...
44 ... ... ... ... ... ... ...
45 ... ... ... ... ... ... ...
46 ... ... ... ... ... ... ...
47 ... ... ... ... ... ... ...
48 ... ... ... ... ... ... ...
49 ... ... ... ... ... ... ...
50 ... ... ... ... ... ... ...
51 ... ... ... ... ... ... ...
52 ... ... ... ... ... ... ...
53 ... ... ... ... ... ... ...
54 ... ... ... ... ... ... ...
55 ... ... ... ... ... ... ...
56 ... ... ... ... ... ... ...
57 ... ... ... ... ... ... ...
58 ... ... ... ... ... ... ...
59 ... ... ... ... ... ... ...
60 ... ... ... ... ... ... ...
61 ... ... ... ... ... ... ...
62 ... ... ... ... ... ... ...
63 ... ... ... ... ... ... ...
64 ... ... ... ... ... ... ...
65 ... ... ... ... ... ... ...
66 ... ... ... ... ... ... ...
67 ... ... ... ... ... ... ...
68 ... ... ... ... ... ... ...
69 ... ... ... ... ... ... ...
70 ... ... ... ... ... ... ...
71 ... ... ... ... ... ... ...
72 ... ... ... ... ... ... ...
73 ... ... ... ... ... ... ...
74 ... ... ... ... ... ... ...
75 ... ... ... ... ... ... ...
76 ... ... ... ... ... ... ...
77 ... ... ... ... ... ... ...
78 ... ... ... ... ... ... ...
79 ... ... ... ... ... ... ...
80 ... ... ... ... ... ... ...
81 ... ... ... ... ... ... ...
82 ... ... ... ... ... ... ...
83 ... ... ... ... ... ... ...
84 ... ... ... ... ... ... ...
85 ... ... ... ... ... ... ...
86 ... ... ... ... ... ... ...
87 ... ... ... ... ... ... ...
88 ... ... ... ... ... ... ...
89 ... ... ... ... ... ... ...
90 ... ... ... ... ... ... ...
91 ... ... ... ... ... ... ...
92 0.117 ... ... ... ... ... ...
0j
93 ... 0.183 ... ... ... ... ...
0j
94 ... ... 4.22 ... ... ... ...
0j
95 ... ... ... 0.117 ... ... ...
0j
96 ... ... ... ... 0.183 ... ...
0j
97 ... ... ... ... ... 4.22 ...
0j
98 ... ... ... ... ... ... 0.117
0j
99 ... ... ... ... ... ... ...
100 ... ... ... ... ... ... ...
101 ... ... ... ... ... ... ...
102 ... ... ... ... ... ... ...
99 100 101 102
1 ... ... ... ...
2 ... ... ... ...
3 ... ... ... ...
4 ... ... ... ...
5 ... ... ... ...
6 ... ... ... ...
7 ... ... ... ...
8 ... ... ... ...
9 ... ... ... ...
10 ... ... ... ...
11 ... ... ... ...
12 ... ... ... ...
13 ... ... ... ...
14 ... ... ... ...
15 ... ... ... ...
16 ... ... ... ...
17 ... ... ... ...
18 ... ... ... ...
19 ... ... ... ...
20 ... ... ... ...
21 ... ... ... ...
22 ... ... ... ...
23 0.0557 ... ... ...
0j
24 ... -0.0705 -0.00205 0.0557
0j 0j 0j
25 ... ... ... ...
26 ... ... ... ...
27 ... ... ... ...
28 ... ... ... ...
29 ... ... ... ...
30 ... ... ... ...
31 ... ... ... ...
32 ... ... ... ...
33 ... ... ... ...
34 ... ... ... ...
35 ... ... ... ...
36 ... ... ... ...
37 ... ... ... ...
38 ... ... ... ...
39 ... ... ... ...
40 ... ... ... ...
41 ... ... ... ...
42 ... ... ... ...
43 ... ... ... ...
44 ... ... ... ...
45 ... ... ... ...
46 ... ... ... ...
47 ... ... ... ...
48 ... ... ... ...
49 ... ... ... ...
50 ... ... ... ...
51 ... ... ... ...
52 ... ... ... ...
53 ... ... ... ...
54 ... ... ... ...
55 ... ... ... ...
56 ... ... ... ...
57 ... ... ... ...
58 ... ... ... ...
59 ... ... ... ...
60 ... ... ... ...
61 ... ... ... ...
62 ... ... ... ...
63 ... ... ... ...
64 ... ... ... ...
65 ... ... ... ...
66 ... ... ... ...
67 ... ... ... ...
68 ... ... ... ...
69 ... ... ... ...
70 ... ... ... ...
71 ... ... ... ...
72 ... ... ... ...
73 ... ... ... ...
74 ... ... ... ...
75 ... ... ... ...
76 ... ... ... ...
77 ... ... ... ...
78 ... ... ... ...
79 ... ... ... ...
80 ... ... ... ...
81 ... ... ... ...
82 ... ... ... ...
83 ... ... ... ...
84 ... ... ... ...
85 ... ... ... ...
86 ... ... ... ...
87 ... ... ... ...
88 ... ... ... ...
89 ... ... ... ...
90 ... ... ... ...
91 ... ... ... ...
92 ... ... ... ...
93 ... ... ... ...
94 ... ... ... ...
95 ... ... ... ...
96 ... ... ... ...
97 ... ... ... ...
98 ... ... ... ...
99 0.183 ... ... ...
0j
100 ... 4.22 ... ...
0j
101 ... ... 0.117 ...
0j
102 ... ... ... 0.183
0j
Largest element in matrix = 133.3.
Smallest element in matrix = 0.002047.
Largest pivot element = 133.3.
Smallest pivot element = 0.06297.
Density = 2.92%.
i=0 133.212 0
i=1 9.41625 0
i=2 133.269 0
i=3 0.0941095 0
i=4 0.0629654 0
i=5 0.0629654 0
i=6 0.0629654 0
i=7 0.0629654 0
i=8 0.0629654 0
i=9 0.0629654 0
i=10 0.0629654 0
i=11 0.0629654 0
i=12 0.0629654 0
i=13 0.0629654 0
i=14 0.0629654 0
i=15 0.0629654 0
i=16 0.0629654 0
i=17 0.0629654 0
i=18 0.0629654 0
i=19 0.0629654 0
i=20 0.0629654 0
i=21 0.0629654 0
i=22 0.0629654 0
i=23 0.0941095 0
i=24 0.0931828 0
i=25 0.124373 0
i=26 0.0829321 0
i=27 0.0829321 0
i=28 0.0829321 0
i=29 0.0829321 0
i=30 0.0829321 0
i=31 0.0829321 0
i=32 0.0829321 0
i=33 0.0829321 0
i=34 0.0829321 0
i=35 0.0829321 0
i=36 0.0829321 0
i=37 0.124373 0
i=38 0.15022 0
i=39 4.22356 0
i=40 0.117426 0
i=41 0.183198 0
i=42 4.22356 0
i=43 0.117426 0
i=44 0.183198 0
i=45 4.22356 0
i=46 0.117426 0
i=47 0.183198 0
i=48 4.22356 0
i=49 0.117426 0
i=50 0.183198 0
i=51 4.22356 0
i=52 0.117426 0
i=53 0.183198 0
i=54 4.22356 0
i=55 0.117426 0
i=56 0.183198 0
i=57 4.22356 0
i=58 0.117426 0
i=59 0.183198 0
i=60 4.22356 0
i=61 0.117426 0
i=62 0.183198 0
i=63 4.22356 0
i=64 0.117426 0
i=65 0.183198 0
i=66 4.22356 0
i=67 0.117426 0
i=68 0.183198 0
i=69 4.22356 0
i=70 0.117426 0
i=71 0.183198 0
i=72 4.22356 0
i=73 0.117426 0
i=74 0.183198 0
i=75 4.22356 0
i=76 0.117426 0
i=77 0.183198 0
i=78 4.22356 0
i=79 0.117426 0
i=80 0.183198 0
i=81 4.22356 0
i=82 0.117426 0
i=83 0.183198 0
i=84 4.22356 0
i=85 0.117426 0
i=86 0.183198 0
i=87 4.22356 0
i=88 0.117426 0
i=89 0.183198 0
i=90 4.22356 0
i=91 0.117426 0
i=92 0.183198 0
i=93 4.22356 0
i=94 0.117426 0
i=95 0.183198 0
i=96 4.22356 0
i=97 0.117426 0
i=98 0.183198 0
i=99 4.22356 0
i=100 0.117426 0
i=101 0.183198 0
x distance(x) input(x) input_phase(x) transfer(x) transfer_phase(x) ratio(x)
0
oc>
actually the output is much much longer but I couldn't post the whole thing :) I guess it has to do with the library for matrix calculations that is being used? Particularly, this library seems to fit the bill: http://www.netlib.org/sparse/spoutput.c . I'll look through the Impedence.compute code a bit now.
EDIT: I just realized I'm a bit confused. What happens if I never directly call the compute() function? When I call input or ratio or transfer will it still use the extended calculations into account?
-
ted
- Site Admin
- Posts: 6398
- Joined: Wed May 18, 2005 4:50 pm
- Location: Yale University School of Medicine
- Contact:
Re: Morphoelectrotonic Transform
That is ugly. I'd suggest installing one of the 7.2 alphas, e.g.
http://www.neuron.yale.edu/ftp/neuron/v ... 0.4.11.dmg
or, if you can compile from source code, then get the latest development code from the mercurial repository and build NEURON from that--see
http://www.neuron.yale.edu/neuron/download/getdevel
http://www.neuron.yale.edu/ftp/neuron/v ... 0.4.11.dmg
or, if you can compile from source code, then get the latest development code from the mercurial repository and build NEURON from that--see
http://www.neuron.yale.edu/neuron/download/getdevel
Re: Morphoelectrotonic Transform
perfect, that works. you the man.ted wrote:That is ugly. I'd suggest installing one of the 7.2 alphas, e.g.
http://www.neuron.yale.edu/ftp/neuron/v ... 0.4.11.dmg
or, if you can compile from source code, then get the latest development code from the mercurial repository and build NEURON from that--see
http://www.neuron.yale.edu/neuron/download/getdevel